Existem três tipos de vírus Influenza: A, B e C. O tipo A é subdividido em subtipos com base nas suas diferenças antigênicas em glicoproteínas de superfície: hemaglutinina (HA) e neuraminidase (NA). Atualmente, conhecem-se 16 subtipos de hemaglutinina (H1 a H16) e 9 subtipos de neuraminidase (N1 a N9) que infectam aves. Um novo subtipo (H17) e uma nova neuraminidase (N10) foram encontrados em morcegos.
Dos 16 subtipos de hemaglutinina que podem ser encontrados em aves, três deles (H5, H7 e H9) provocam casos de infecções humanas.
O subtipo H5N1, de alta patogenicidade, quando infectou humanos, causou uma doença aguda com alta mortalidade (> 60%).
O subtipo H7, de baixa patogenicidade, na maioria dos casos, causa apenas sintomas clínicos de conjuntivite.
O subtipo H9 (principalmente H9N2), também de baixa patogenicidade afeta aves de curral e aves selvagens, e está adaptado preferencialmente a galinhas e codornas, foram encontrados na Ásia, América do Norte, Europa, África e Pacífico. Este subtipo causa sinais leves nas aves, mas suas infecções podem ser complicadas secundariamente com infecções bacterianas.
Quando infectou humanos, causou um quadro gripal.
O subtipo H9 que circula na China, tem-se preocupado desde a década de 1990 por ter-se detectado, produzindo algumas infecções humanas, em alguns casos, adaptada para interagir com os receptores nas células humanas, as quais poderiam provocar uma pandemia humana após sua adaptação.
Este subtipo H9, ao contrário do que aconteceu com o subtipo H5 de alta patogenicidade, causou apenas infecções leves, sem evidências consistentes de transmissão inter-humana.
O subtipo H9, tinha muitas recombinações, de modo que geraram 98 genótipos diferentes, que seriam agrupados em série 9 (A a G), e teria resultado em até 74 diferentes linhagens com acentuadas diferenças como as espécies hospedeiras e áreas geográficas. Os genes que codificam proteínas externas estão intimamente relacionados com H3, H4, H5m, H7, H10 e H14.
Não é raro que o hospedeiro natural (aves de curral como galinhas e codornas), possam encontrar-se infectadas pelos subtipos H9 e H5, o que implicaria o risco de que o subtipo H9, de baixa patogenicidade, poderia adquirir genes do subtipo H5 da alta patogenicidade.
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